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Anwendungen der Barcode In der Medikamentenentwicklung

Jul 26, 2017

Anwendungsmöglichkeiten der Barcode inMedikamentEntwicklung

Die Studie sagt:

Barcoding hat zahlreiche Anwendungsmöglichkeiten in verschiedenen Stadien der Arzneimittelforschung wie Drogen-screening, Tiefe Phänotypisierung, Entdeckung von Biomarkern und pharmakodynamischen Marker Entdeckung. Verwendung von automatisierten Debarcoding Software ermöglicht schneller und relativ unvoreingenommen Entfaltung der verschiedenen Barcode-Proben. Barcoding Proben und CyTOF sind aktuell verwendeten in Längsrichtung klinische Untersuchungen wie einer kürzlich erschienenen Publikation zeigt CyTOF Analyse von zirkulierenden belegt ist und T-Zellen von Patienten mit Glioblastom Tumor infiltrieren behandelt mit Nivolumab ( PD-1-Blocking Antikörper). In dieser klinischen Studie wurden 400 Barcode-Proben (in Chargen von 20 Proben) erzeugt vom zirkulierenden Blut und Tumor infiltrieren Lymphozyten von Glioblastom-Patienten vor und nach der Nivolumab Behandlung. Den Ertrag und die Trennung von jeder Barcode-Probe war gut definierten und zwischen 20 Barcodes Proben vergleichbar.


Abbildung zeigt die Debarcoding und die Analyse von 20 Proben. PBMC wurden gesammelt von gesunden Probanden. Abbildung 2 b zeigt den Ertrag und die Trennung der einzelnen 20 Barcodes Proben nach Debarcoding. Der "Ereignis" Plot zeigt alle Zelle Ereignisse, Barcode zugewiesen. Oberen Bereich stellt die Ausbeute an jedes der Beispiele (als Anzahl der Zellen) nach dem Färben, waschen, Barcoding, Debarcoding und die Beseitigung von Schutt und Dubletten. Im unteren Bereich zeigt die Barcode-Etiketten für die einzelnen Zellen in einer Probe und wie gut sind sie getrennt/gruppiert, zum Beispiel: die kombinierte rot, blau, grün wurde der Barcode zugewiesen, diese Probe; andere Proben wurden die anderen Farben zugeordnet.


Wir haben beobachtet, dass Debarcoding im Hinblick auf den Ertrag und die Trennung Ergebnisverbesserung bei die Probe gereinigt wird (gating, Schutt und Doubletten nach DNA-Intercalator Färbung) vor der Anwendung der Debarcoding-Software. CyTOF-Analyse ergab, dass die Behandlung verschiebt sich das Profil des zirkulierenden regulatorischer T-Zellen (Tregs) in Richtung Erschöpfung des Phänotyps erinnert an die der Tumor infiltrieren Tregs, Produktion von inflammatorischen Zytokinen (IFN-γ) weiter zu erhöhen.


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